Основным продуктом MikroTik является операционная система на базе Linux, известная как MikroTik RouterOS. Устанавливается на персональный компьютер или сервер, он превращает компьютер в сетевой маршрутизатор, реализуя такие функции, как правила брандмауэра, сервер и клиент виртуальной частной сети (VPN), формирование полосы пропускания и качество обслуживания, функции точки беспроводного доступа и другие широко используемые функции для маршрутизации и соединения сетей. Система также может служить системой доступа к точкам доступа на основе порталов. Операционная система лицензируется при повышении уровня обслуживания, каждый из которых освобождает больше доступных функций RouterOS. Программное приложение Windows под названием Winbox предоставляет графический интерфейс пользователя для настройки и мониторинга RouterOS, но программное обеспечение также позволяет подключаться через FTP, telnet и защищенную оболочку (SSH). Программирование приложений доступно для прямого доступа из пользовательских приложений для управления и мониторинга.